Il perossido di idrogeno è instabile e si decompone facilmente in ossigeno e acqua, il che è abbastanza sicuro da questo punto. Gli studi hanno confermato che il residuo di perossido di idrogeno nei prodotti imbevuti di acqua si decomporrà gradualmente e scomparirà durante il processo di ammollo e anche la successiva lavorazione lo distruggerà rapidamente.
Nel 2004, il Comitato di esperti dell'Organizzazione mondiale della sanità (JECFA) ha valutato che i residui di perossido di idrogeno negli alimenti sono così bassi che quando i consumatori lo mangiano, si è degradato quasi al punto da non costituire un problema, quindi non è necessario per stabilire una "assunzione sicura".
Anche la Food and Drug Administration degli Stati Uniti classifica il perossido di idrogeno come GRAS (ovvero, ragionevolmente sicuro) ed è generalmente utilizzato nella quantità richiesta per la produzione (vale a dire, uso illimitato). Ad esempio, la quantità massima utilizzata nel pesce azzurro affumicato e nelle uova in salamoia è "per ottenere effetti ossidanti e antibatterici", e la quantità massima utilizzata nella lavorazione della trippa è "per ottenere un effetto sbiancante". Inoltre, il perossido di idrogeno può essere utilizzato anche per pulire e disinfettare frutta e verdura.
Il perossido di idrogeno medico con una concentrazione del 3 percento non è generalmente un grosso problema anche se viene assunto per errore. Ma se il perossido di idrogeno con una concentrazione del 30 percento viene bevuto direttamente, può bruciare il tratto digestivo. Tuttavia questo è estremamente raro perché la persona media non entra in contatto con una concentrazione così elevata di perossido di idrogeno.
Inoltre, il perossido di idrogeno può decomporsi rapidamente in sali di metalli pesanti, ambienti alcalini e impatti violenti e persino causare esplosioni. Ciò si verifica generalmente durante la produzione, lo stoccaggio e il trasporto del perossido di idrogeno ed è improbabile che venga riscontrato dai consumatori.